粪便样本中的微生物DNA保存是微生物组研究的关键步骤,保存方法直接影响DNA的质量和后续分析结果的可靠性。以下是几种常见的粪便样本微生物DNA保存方法:
1.立即冷冻法
方法:采集粪便样本后,立即放入-80℃超低温冰箱保存。
优点:简单直接,能有效防止DNA降解。
缺点:需要依赖超低温设备,不适合野外或资源有限的场景。
适用场景:实验室环境,有条件立即冷冻的情况。
2.保存液法
使用专门的粪便微生物DNA保存液(如粪便样本微生物DNA保存液等)。
方法:将粪便样本与保存液按说明书推荐比例混匀,常温或低温保存。
优点:
1)可实现粪便本的常温运输和常温保存,确保样本中宿主与微生物DNA不发生降解;
2)所保存的样本,使用大多数商业化核酸提取纯化试剂盒进行提取纯化后,可获得高质量和完整性良好的DNA产物;
3)能抑制各种病毒或细菌生长,杀灭各种传染因子,实现样本的安全运输。
4)方便运输和野外采样。
缺点:保存液成本较高。
适用场景:野外采样、长途运输或无法立即冷冻的情况。
3.乙醇保存法
方法:将粪便样本与无水乙醇按1:1或1:2比例混合,4°C或常温保存。
优点:乙醇能抑制微生物生长和核酸酶活性。乙醇的成本低,易于获取。
缺点:长期保存可能导致DNA部分降解。不适合RNA保存。
适用场景:短期保存或资源有限的实验室。
4.冻干法
方法:将粪便样本冷冻干燥,去除水分后常温保存。
优点:常温下可长期保存。减少样本体积,便于存储和运输。
缺点:需要冻干设备。同时可能影响某些微生物的DNA完整性。
适用场景:长期保存或需要减少样本体积的情况。
5.注意事项
样本量:确保采集足够的粪便样本(通常0.5-1g)。
均匀混合:保存前将粪便样本充分混匀,确保微生物分布均匀。
避免污染:使用无菌工具采集和保存样本,防止外源DNA污染。
记录信息:记录采样时间、保存方法和条件,便于后续分析。
选择合适的粪便微生物DNA保存方法应根据实验需求、设备条件和样本用途综合考虑。
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